Le fonds Trembley provient des archives ayant appartenu à Maurice Trembley (1874-1942) et qui sont restées dans sa maison de Bellefontaine, quai de Cologny, jusqu'à la mort de sa femme en 1964. Maurice Trembley avait trouvé la majeure partie des originaux de ces archives à Saconnex, propriété de la famille Trembley de 1757 à 1937. Cette propriété avait été acquise par Abraham Trembley à son retour à Genève après plus de vingt ans d'absence à l'étranger, en Hollande, en Angleterre enfin lors d'un périple, avec le jeune duc de Richemond, qui le conduisit à travers l'Europe, en Allemagne, en France, en Italie. A la mort de Madame Maurice Trembley (1964), ses fils Fernand et Jean se sont répartis les archives comme suit:
Fernand prenant la Bibliothèque (bibliothèque Bonnet-Trembley) ainsi que la majorité des documents et manuscrits relatifs aux sciences (lot A). Cet ensemble fut transféré à Chougny, chez Fernand.
Jean transféra ce qu'il avait pris à Bellefontaine dans sa maison de Vandoeuvres (lot B). En 1984, à l'occasion du Colloque organisé au Museum de Genève, à la mémoire d'Abraham Trembley, par la Société de physique et d'histoire naturelle, Jean étant mort, son fils Alec mit à la disposition du Colloque un certain nombre de documents se trouvant à Vandoeuvres et faisant partie du lot B, en l'occurrence des lettres de la correspondance entre A. Trembley et Martin Folkes et copies faites par Maurice Trembley des lettres d'A. Trembley sur les originaux du British Museum.
A la mort de Fernand (1967), ses enfants se partagèrent les archives (lot A),
- à Nina, sa fille, la bibliothèque (Bibliothèque Bonnet-Trembley) (lot A1),
- à George les manuscrits et documents (lot A2)
Nina fit vendre aux enchères sa part (lot A1), la bibliothèque Bonnet-Trembley par l'Etude de Maîtres M. et E. Reymond (vente des 3 et 4 octobre 1970)
George, professeur de littérature française à Toronto, emporta son lot au Canada. En 1988, George, prenant sa retraite, revint en Europe, rapporta son lot à Sète (France) où il s'installa et y mourut en mai 1992.
En automne 1992, Jacques Trembley rapporta à Genève l'ensemble des manuscrits et documents constituant le lot A2 en accord avec Madame George Trembley et, ainsi qu'il en avait été convenu lors d'une dernière visite de Jacques à son cousin George à Sète en février 1992, remis les papiers à la Bibliothèque publique et universitaire en 1993.